Τα config files του i3 επιτρέπουν στους χρήστες να προσαρμόσουν την εμφάνιση και τη λειτουργικότητα του περιβάλλοντος εργασίας τους, προσφέροντας δυνατότητες όπως η ρύθμιση συντομεύσεων πληκτρολογίου, η επιλογή θεμάτων και η διαχείριση παραθύρων.